Web tabanlı araçları kullanarak temel biyoinformatik analizleri gerçekleştirebilirsiniz ve detaylara girmediğiniz sürece ortaya kayda değer sonuçlar çıkarabilirsiniz. Ancak burada unutulmaması gereken bir şey var: çoğu zaman verileri analize hazırlamak, analizin kendisinden çok daha fazla emek ve zaman gerektirir. Elinizdeki dosyaları FASTA biçimine çevirmek, onlarca farklı dosyada yer alan verileri tek bir dosyada tablo şeklinde toplamak, veritabanlarından otomatik olarak veri çekmek, veya veriyi bir yerden başka bir yere kopyalamak.
UNIX tabanlı işletim sistemlerinin bu tarz işlemleri kolaylaştırmak amacıyla geliştirildiğini söylesek sanırım yanılmış olmayız. Farklı Linux sürümleri arasında bu sıralar en popüler ve kullanışlı olanı Ubuntu, alternatif olarak da Mac işletim sisteminden bahsedebiliriz. Windows'ta komutları teker teker yazmak yerine bunları bir grafik arayüzünün arkasına gizleyip kullanıcıya daha basit şeyler göstermek kuşkusuz kişisel bilgisayarın yaygınlaşmasında büyük rol oynamıştır, ancak aynı zamanda da bilgisayarın nasıl çalıştığını anlamak noktasında kullanıcıyla bilgisayarın mantığı arasına bir perde çektiği de muhakkak. Özetle, programlama araçlarını tanımak ve etkin bir şekilde kullanmak, büyük miktarlarda veriyle uğraşanların olmazsa olmazı. Bu doğrultuda sizinle 3 farklı örnek paylaşmak istiyorum.